Dma, я решаю этот вопрос через JavaScript. Т.е. выбор одного из вариантов доставки является событием для скрытия/отображения определенных вариантов оплаты. Что именно показывать/скрывать жестко прописано в коде по ID вариантов. Это самый быстрый способ реализации. Можно, конечно, сделать и интерфейс в админке (я даже видел подобные расширения, но только для стандартной корзины VM), но это значительно сложнее.
Если вам нужно решить задачу, могу помочь за отдельную плату. Пишите через обратную связь.
